Dentro de las áreas en donde sí se procesan alimentos se pueden subdividir en:
Áreas de buenas prácticas de higiene básicas: donde los alimentos están crudos, tienen envase y/o apenas serán sometidos a procesos de limpieza o tratamiento térmico.
Áreas de control de patógenos primarios: aquellas donde los productos están cocidos, pasteurizados, listos para consumir y donde están expuestos al ambiente, Requieren estricto control de higiene.
Áreas sensibles de alto nivel de higiene: áreas donde se producen alimentos para poblaciones sensibles como lactantes o enfermos.
Áreas de transición pueden considerarse todas aquellas donde el personal realiza ciertas prácticas de higiene como lavado de manos y coloca vestimenta apropiada para ingresar.